1956年,Theodore Puck從中國倉鼠中分離出的卵巢細胞(Chinese Hamster Ovary,CHO),憑著耐受強、重組基因擴增和表達高效等特性,成為生產蛋白類藥物的shouxuan宿主。
作為新藥和新疫苗開發的全球lingjun企業,GSK(葛蘭素史克)便瞄準到中國倉鼠卵巢細胞(CHO)培養工藝的開發中,計劃用于生產單克隆抗體。
而規模化生產抗體等生物藥的關鍵,在于在人工控制條件下的生物反應器中懸浮培養細胞。
由于活性產物會在細胞內經歷復雜的生物反應,要想Zui大限度提高產量和質量,首先需要量化CQA與CMA、CPP的關系:
CQA(關鍵質量屬性):
活細胞濃度,活性百分比,營養素(例如葡萄糖),代謝物(例如谷氨酰胺),單抗滴度等
CMA(關鍵物料屬性):
細胞特性,培養基成分等
CPP(關鍵工藝參數):
進料策略(時間、劑量),pH,溫度,溶氧度等
尤其對于CHO細胞而言,其代謝特點是葡萄糖和谷氨酰胺攝取率高,以及乳酸和銨鹽的代謝副產物分泌率高。其中乳酸如果超標,不但會抑制細胞生長和蛋白質產生,甚至會導致細胞死亡。
減少乳酸Zui常用的方法,就是控制培養基中的葡萄糖含量,讓其盡可能達到培養zuijia濃度(過高不完全氧化產生乳酸、過低則會影響細胞生長和產能),這就需要對葡萄糖的消耗與需求、乳酸的生產速率,以及目的蛋白的表達量等多組參數進行綜合考慮,并平衡葡萄糖和Gln的比例,調整進料策略。
在過去,傳統工藝開發方式,一般會花費大量時間、財力、人工成本來設計和實施海量實驗,走彎路難以避免,且投入產出比往往很低。
為了高效優化生物反應器控制和補料策略等設定點,Zui大化高質量產品的生產,GSK迫切期望利用新的方法工具,加速實驗設計和細胞培養工藝的探索進程。
模型落地三步走,讓策略優化少走彎路
縱觀整個生物制藥行業,為了減少實驗負擔,用機理模型來模擬細胞培養過程動力學,逐漸成為了行業發展的一種趨勢。雖然一直以來,人們對于細胞培養動力學建模的學術研究十分活躍,但這些模型尚未在工業中廣泛采用,且許多企業至今仍然缺乏非專家可以使用的工具。
如何破解細胞培養工藝難題?從哪里開始入門?西門子PSE制藥行業專用的工藝數字孿生軟件gPROMS FormulatedProducts,吸引到了GSK的注意。
多年來,通過快速配置、校準和部署基于科學的、數據校準的數字孿生,gPROMS FormulatedProducts內置有完備的細胞培養動力學模型,可以對工藝上下游進行綜合、全面的分析,幫助了許多國際zhiming制藥企業,快速、輕松汲取來自專業文獻中的知識,解決實際生產難題。
合作伊始,GSK經過西門子制藥團隊的專業培訓和技術支持,系統地學習了機理建模方法,并決定通過三步走的方式,讓數字模型在現實培養場景中落地生根、開花結果:
第一步:模型選擇
針對CHO細胞培養過程,GSK采用了描述細胞在單一有機底物下生長和代謝過程的Monod細胞反應動力學模型。
GSK所借助的Monod模型由14個方程和25個參數組成,如表征細胞的比生長速率與限制性底物濃度之間關系方程等,能全面描述CHO細胞的補料分批環境。
Monod模型中的有代表性的公式
通過建立這些方程,GSK得以對整個培養和生產過程,包括對細胞生長、死亡、裂解,細胞分泌的副產物(如氨、乳酸等)變化速率,傳質、傳熱和能量消耗等復雜過程,進行框架描述和參數求解。
用方程表達數據聯系,對于將數據轉化為可用知識、加快企業技術轉移、工藝放大大有裨益。
當然,除了軟件中預定義的模型外,gPROMS FormulatedProducts中的模型自定義功能,還可以讓工藝開發者自由展開二次開發,以探索更新穎的機理模型、捕捉更復雜的現象、拓展更多可能性。
第二步:模型校準和驗證
當生物反應器機理模型配置完畢,如何確定保證機理模型的jingque性呢?下一步就需要通過準確估算機理模型中的未知參數來校準模型,并用實驗數據來驗證模型預測的準確性。
四種實驗條件下活細胞濃度(左)和單抗滴度(右)的模型軌跡(線)和實驗數據(點)
其它工藝參數的模型軌跡(線)與控制條件的實驗數據(點)的對比
不同于從零開始的探索,GSK只需要用少量、有針對性的變量控制實驗(如補料頻率和滴度變化等),就能完成模型的參數估計工作、充分表征工藝過程。
如上圖所示,該模型的擬合程度已經較高,很好地達到了GSK的理想預期。gPROMS FormulatedProducts讓GSK快速明確了工藝優化方向,大大提高研發效率,減少材料和時間的浪費。
第三步:模型的應用
除了繁雜的輸入、輸出變量外,細胞培養過程中還會面臨許多不可控因素,如環境變量和突發事件等對產品質量的影響。
如何有效評估這些因素對工藝系統的影響程度呢?這就不得不提gPROMS FormulatedProducts的GSA全局系統分析中的敏感性分析功能。
GSA利用校準好的模型充分評估CQA與CMA、CPP之間的相互關系,確定理想的工藝操作區間,以及模型中需要額外調整的區域。當然反過來,理想的操作區間確定后,也可以用于計算機虛擬實驗,優化工藝條件以滿足指定的模型輸出,Zui終實現優化工藝設計的目的。
標準化后的敏感性指數總結
在gPROMS FormulatedProducts的幫助下,GSK可以很好地識別關鍵質量屬性(CQAs)對關鍵工藝參數(CPPs)和關鍵材料屬性(CMA)的敏感性,精準鎖定關鍵工藝參數,充分探索設計空間。
依托GSA的強大功能,GSK可以按總效應指數,在計算機上對各個影響因素的敏感性進行排序。如上圖所示,Zui終確定了與乳酸消耗和分泌相關的參數,對于模型反應的影響Zui大。
Zui終,基于gPROMS FormulatedProducts提供的cell culture動力學模型,GSK捕獲了多個關鍵的CHO細胞培養過程變量的變化——包括葡萄糖、活細胞濃度(VCC)和滴度等。
客戶收益
在實際應用過程中,GSK用計算機模擬替代繁瑣實驗,讓工藝優化從完全以實驗數據驅動,轉為僅需少量實驗數據的機理模型,不僅大幅節省了DoE實驗的時間、材料和人工花費,打開了用更低成本實現更佳效果的全新思路。
由于gPROMS FormulatedProducts具備系統性模擬的功能,可以用于仿真系統中任一單元某變量的變化對全局系統造成的影響。
因此在工藝過程數字化中,可以有效降低突發事件、設備意外(如泵發生損壞,沒有及時排出代謝副產物)等造成的負面影響,保障生產效率和藥品質量達標、縮短藥品上市周期。
現階段,GSK正在繼續完善模型,擴大該機理模型在優化進料策略上的應用,并不斷加深對細胞生長動力學機理模型和工藝流程的理解。
gPROMS:端到端數字孿生的全局賦能
近年來,基于細胞動力學機理模型的開發方式,為從細胞培養到分離純化的全局藥物制備Zui優工藝探索,創造前所未有的便捷。
gPROMS FormulatedProducts工藝數字孿生為R&D、工程應用、實際生產帶來了高效預測和指導,并為用戶優化過程設計、風險評估、設計空間探索,帶來前所未有的便捷。
系統擁有貫穿生物制藥上下游的數字孿生模型
當然,作為全生命周期的仿真軟件,gPROMS FormulatedProducts 的應用不只局限于生物反應器,而是能全面貫穿從上游細胞培養,下游層析過濾,到制劑的各流程。覆蓋上下游的機理模型,能為生物制藥企業提供一整套端到端的流程仿真解決方案。
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